因應兩岸平日包機擴増至定期航班，華航與華信共同執行兩岸定期航班，即日起預先開始接受訂位，新增廈門、寧波、鄭州、瀋陽、長沙、西安 6 航點，若包括現有上海、北京、深圳、廣州、南京、杭州、成都 7 航點，則共計13 個航點。航班由原每周 22 班次增加至每周 55 班次，包含台北、高雄出發之定期班機及台中出發之定期包機，提供兩岸旅客更舒適、便捷的服務。有關實際開票日期仍須主管機關核定公佈。
華航集團規劃桃園/高雄-上海每周 11 班，桃園-北京每周 5 班，桃園-廣州每周 5 班，桃園/高雄-深圳每周 5 班，桃園-南京每周 2 班，桃園-成都每周 2 班，桃園-西安每周 2 班，桃園-瀋陽每周 2 班，桃園-長沙每周 2 班，桃園/台中/高雄-寧波每周 5 班，桃園-廈門每周 7 班，桃園-鄭州每周 2 班，台中/高雄-杭州每周 5 班。航機分別採用波音B747-400、B737-800、空中巴士A330-300及Embraer 190機型飛行。
2009年華航集團兩岸定期航班預定時間表(起飛到達皆為當地時間)
◎桃園 - 上海 每周9班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 501 | 桃園 - 上海 | 09:05 | 10:50 | 1234567 | 744 |
| CI 502 | 上海 - 桃園 | 12:05 | 13:50 | 1234567 | 744 |
| CI 503 | 桃園 - 上海 | 16:35 | 18:20 | ____5_7 | 744 |
| CI 504 | 上海 - 桃園 | 19:35 | 21:20 | ____5_7 | 744 |
◎高雄 - 上海 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 581 | 高雄 - 上海 | 07:30 | 09:30 | _2___6_ | 333 |
| CI 582 | 上海 - 高雄 | 10:45 | 12:45 | _2___6_ | 333 |
◎桃園 - 北京 每周5班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 511 | 桃園 - 北京 | 08:05 | 11:10 | 1_3_567 | 744 |
| CI 512 | 北京 - 桃園 | 12:25 | 15:35 | 1_3_567 | 744 |
◎桃園 - 廣州 每周5班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 521 | 桃園 - 廣州 | 13:10 | 15:05 | 12_4_67 | 744 |
| CI 522 | 廣州 - 桃園 | 16:20 | 18:20 | 12_4_67 | 744 |
◎桃園 - 深圳 每周4班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 527 | 桃園 - 深圳 | 14:50 | 16:40 | 1_3_5_7 | 744 |
| CI 528 | 深圳 - 桃園 | 17:55 | 19:50 | 1_3_5_7 | 744 |
◎高雄 - 深圳 每周1班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 585 | 高雄 - 深圳 | 08:45 | 10:15 | ___4___ | 333 |
| CI 586 | 深圳 - 高雄 | 11:30 | 13:10 | ___4___ | 333 |
◎桃園 - 南京 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 987 | 桃園 - 南京 | 08:25 | 10:20 | _2___6_ | 333 |
| AE 988 | 南京 - 桃園 | 11:30 | 13:35 | _2___6_ | 333 |
◎桃園 - 成都 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 551 | 桃園 - 成都 | 08:45 | 12:10 | _2____7 | 333 |
| CI 552 | 成都 - 桃園 | 13:10 | 16:35 | _2____7 | 333 |
◎桃園 - 西安 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| CI 561 | 桃園 - 西安 | 11:50 | 16:00 | 1___5__ | 738 |
| CI 562 | 西安 - 桃園 | 17:15 | 21:25 | 1___5__ | 738 |
◎桃園 - 瀋陽 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 975 | 桃園 - 瀋陽 | 08:35 | 12:25 | _2___6_ | 738 |
| AE 976 | 瀋陽 - 桃園 | 13:40 | 17:45 | _2___6_ | 738 |
◎桃園 - 長沙 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 977 | 桃園 - 長沙 | 09:25 | 11:50 | __3_5__ | 738 |
| AE 978 | 長沙 - 桃園 | 13:05 | 15:35 | __3_5__ | 738 |
◎桃園 - 寧波 每周3班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 989 | 桃園 - 寧波 | 15:45 | 17:20 | 1_3__6_ | 333 |
| AE 990 | 寧波 - 桃園 | 18:35 | 20:20 | 1_3__6_ | 333 |
◎台中 - 寧波 每周1班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 7251 | 台中 - 寧波 | 16:30 | 18:10 | ____5__ | E90 |
| AE 7252 | 寧波 - 台中 | 19:10 | 21:00 | ____5__ | E90 |
◎高雄 - 寧波 每周1班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 997 | 高雄 - 寧波 | 07:55 | 09:55 | ______7 | 333 |
| AE 998 | 寧波 - 高雄 | 11:10 | 13:10 | ______7 | 333 |
◎桃園 - 廈門 每周7班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 991 | 桃園 - 廈門 | 08:40 | 10:30 | 1234567 | 333 |
| AE 992 | 廈門 - 桃園 | 11:40 | 13:30 | 1234567 | 333 |
◎桃園 - 鄭州 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 993 | 桃園 - 鄭州 | 08:35 | 11:20 | 1__4___ | 738 |
| AE 994 | 鄭州 - 桃園 | 12:35 | 15:20 | 1__4___ | 738 |
◎台中 - 杭州 每周2班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 7235 | 台中 - 杭州 | 11:00 | 12:40 | __3___7 | E90 |
| AE 7236 | 杭州 - 台中 | 13:40 | 15:25 | __3___7 | E90 |
◎高雄 - 杭州 每周3班
| 班機號碼 | 行程 | 起飛時間 | 抵達時間 | 每週飛航 | 機型 |
| AE 995 | 高雄 - 杭州 | 07:45 | 09:50 | 1_3_5__ | 333 |
| AE 996 | 杭州 - 高雄 | 11:00 | 13:10 | 1_3_5__ | 333 |